（1）细菌形态学检验
观察细菌形态通常需将细菌或含有细菌的血液、组织等制成玻片标本，经固定、染色后镜检。染色的方法可分为单染法（如美蓝染色）、鉴别染色法（如革兰氏染色、抗酸染色）、特殊染色法（如芽孢染色、鞭毛染色）和血片、组织片的染色法（如姬姆萨染色、瑞氏染色）等。
（2）细菌的分离与培养。
（3）药敏试验
测定致病细菌对药物的敏感程度，有助于临诊上选用合适的药物进行治疗。在采用中草药治疗疾病时，亦可用药敏试验来测定中草药的抗菌性能。
药敏试验最常用的是纸片法，所需纸片可向有关单位购买，亦可自行配制。
主要包含常规微生物检测细菌总数、大肠菌群、霉菌、酵母等
以及食源性致病菌微生物检测
沙门氏菌、志贺氏菌、大肠埃希氏菌、副溶血性弧菌、金黄色葡萄球菌德等
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