简单的来说，它们之间的不同，是由于个体间大小的差异而决定的。但是之所以后来一样了，是因为，它们都被当做了生物的一个种群，是平等的，所以相同。
首先单细胞生物是由单个细胞构成的,而组织是由多个细胞按一定规律排列而成的,器官是由多种组织按一定的生理特性构成的,系统是有多个器官按一定的生理特性组成的,因此单细胞生物不具有系统、组织、器官这三个层次. 因为植物的那些器官种类少,功能简单,不足以构成系统.第一：微生物个体通常就是细胞本身，除大型真菌外，没有复杂的细胞分化现象，更不会分化为不同组织，病毒则没有细胞结构，只有核酸和外壳蛋白构成。第二：细胞结构简单，没有细胞器和复杂的内膜系统。
第四：原核细胞如细菌染色体只有核酸，没有蛋白，基因构成没有外显子和内含子。
第五：营养物质吸收方式简单，靠细胞膜调控，
第六：代谢调控简单，直接与环境相关，而没有神经调控，长距离运输等，所有生物反应调节在细胞质中进行。
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