一，实验用胶囊不同。c13呼气实验使用的尿素胶囊含有碳十三。c14呼气实验使用的尿素胶囊含有碳十四。
二，使用的实验材料的放射性不同。c13呼气实验使用的尿素胶囊含有C-13，是一种稳定性比较好的检测材料，放射性可以忽略。c14呼气实验使用的尿素胶囊含有C-14，这是一种相对于C-13来说稳定性差一点的元素，会微量的放射出射线也就是“辐射”。
三，实验的禁忌不同。c13实验不禁止参与实验的病患。c14实验由于具有微量放射性，孕妇、哺乳期妇女及13岁以下儿童不宜碳14试验。
c13及c14的检测注意：
1、检测当日，患者需要空腹或禁食三小时后方可检查。
2、胶囊需用温水完整口服，切忌咬碎，以免影响检测结果的准确性。
3、近期服用过抗生素、铋剂、质子泵抑制剂等幽门螺杆菌敏感药物可能影响诊断结果，检测前请停用此类药物。如有服药史，一定要向医生说明。
4、上消化道急性出血可使幽门螺杆菌受抑制，所以应在消化道出血停止一周以后再进行检测。
5、胃切除手术可能造成同位素从胃中快速排空，将影响幽门螺杆菌的检测效果。
参考资料来源：百度百科-C-13呼气实验检测系统
会有误检查的情况，主要看你用哪种检测方法。一般c13检测误检概率不大，c14比c13稍微大一点点，但是总体来说还是很小的。
但是如果用血液检测的话，由于实际检测的是hp的抗体是否存在，这个就会有误检的情况，有抗体只能说明你曾经有过hp，并不能代表你现在的结果，因为抗体不是终身的。
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