医院的整体水平和医疗条件肯定是三院更好一些，不过六院原来就是广东省胃肠肛门医院，所以在胃肠肛门、消化科方面是要比三院强的。
中山大学附属第六医院：
中山大学附属第六医院(广东省胃肠肛门医院)是一所综合医院。
中山大学附属第六医院位于广州市天河区员村二横路26号。
地理位置：
广州市天河区员村二横路26号
成立时间：
2007年
医院等级：
三级甲等
医院类型：
综合医院
中山大学附属第三医院：
中山大学附属第三医院是一所集医疗、教学、科研及康复、预防、保健于一体的综合性医院。
地理位置：
广东省广州市天河区天河路600号
成立时间：
1971年
主管部门：
国家卫生部
医院等级：
三级甲等
医院类型：
综合医院
临床医学本科阶段所学基本一致，更高层次的研究方向有所不同，两所医院所设科室也不一样：1.广医一院临床医学主要研究科目有：内科学（呼吸病系）；呼吸内科、胸外科、重症医学科、泌尿外科；中西医结合临床学科；中医肺病专科；内科学，儿科学，外科学；呼吸内科、胸外科、重症医学科、泌尿外科、妇科、血液内科、心血管内科、耳鼻喉科、检验科、神经内科、急诊科、儿科、肿瘤科、消化内科、医学影像科、骨科、感染病科、普通外科、临床护理。
2.广州医科大学附属第二医院主要研究科目有:内科学、神经病学；外科学、妇产科学、儿科学、临床检验诊断学；神经病学；心血管内科、神经外科、重症医学科、神经内科、急诊科、普通外科、康复科、医学检验科；胸外科、肾内科、医学影像科、眼科、内分泌科和呼吸内科；疼痛科、过敏反应科。
概念延伸
1.广州医科大学附属第一医院是一所集医疗、教学、科研、保健、康复、急救于一体的大型三级甲等医院，也是广州呼吸疾病研究所、广州骨科研究所、广州泌尿外科研究所、广州医科大学中西医结合研究所所在医院。
它的前身是始建于1903年“中法韬美医院”，解放后几经调整，先后易名为“广州市工人医院”、“广州市第四人民医院”，1974年归属为广州医学院的附属医院，1981年正式更名为“广州医学院第一附属医院”。2013年更名为“广州医科大学附属第一医院”。
2.广州医科大学附属第二医院（简称广医二院） 于1982年12月正式挂牌，2004年8月成立广州医学院第二临床学院。2013年6月医院正式更名为广州医科大学附属第二医院，广州医学院第二临床学院更名为广州医科大学第二临床学院。
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