一、分布范围不同
1、金边蚂蝗分布范围：分布于印度尼西亚、菲律宾、印度、孟加拉、斯里兰卡、缅甸、泰国、越南、台湾岛以及中国大陆的福建、广东、广西、海南、香港等地，多见于水田、水沟或池塘里。该物种的模式产地在菲律宾吕宋岛。
2、水蚂蝗分布范围：蚂蝗多生活在淡水中，少数生活在咸水之中，还有一些陆生和两栖的。分布于日本、俄罗斯的远东地区、蒙古以及中国大陆的北起东北各省、内蒙古、西至四川、甘肃、南达广东等地。
二、科目不同
1、金边蚂蝗科目：金边蚂蝗属于医蛭形亚目医蛭科生物。
2、水蚂蝗科目：水蚂蝗属于颚蛭目水蛭科生物。
三、主要价值不同
1、金边蚂蝗主要价值：是广西特色的药用动物资源。菲牛蛭唾液腺分泌的天然水蛭素是世界上所发现的物质中较强的天然抗凝血酶物质。
2、水蚂蝗主要价值：医学上多以活体使用，不用来加工药品。
参考资料来源：百度百科-日本医蛭
参考资料来源：百度百科-蚂蝗
参考资料来源：百度百科-菲牛蛭
目前我们说的水蛭素，指的是吸血水蛭所特有的，能与血液中的凝血酶特异性结合的，从而延长血液凝固时间的一种物质。也就是说，不吸血的水蛭是不含该种物质的。据目前我国的研究表明，目前我国最常见的吸血水蛭——菲牛蛭，它的平均抗凝血活性是非吸血的宽体金线蛭的20倍。也就是说，菲牛蛭的药用价值，理论上可以达到宽体金线蛭的20倍。经济价值上，宽体金线蛭是中国药典中的中药，而菲牛蛭目前为止只进入了广西的壮药药典。适用面二者差距巨大，从正常的来说，宽体金线蛭的销路要比菲牛蛭宽得多。
至于国外市场，个人并不看好，水蛭药用只有中医，离开了中医，水蛭是没有市场的，而目前中药争议很大，个人不好在此下结论。
养殖宽体金线蛭的价格最高。晒干后医用价值最高。我们的水蛭分为：
1、宽体金线蛭，不吸血，以贝类生物为食，生长速度快。2、日本医蛭，以动物血液为生，个头较小。3、尖细金线蛭，外形独特，两侧各有一条黄色条纹。4、菲牛蛭，南方常见品种，具有药用价值。5、茶色蛭，体型扁平，属于野生品种。
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