1)日常功能性食品:它是根据各种不同的健康消费群(如婴儿、学生和老年人等)的生理特点和营养要求而设计的，旨在促进生长发育、维持活力和精力，强调其成分能够充分显示身体防御功能和调节生理规律的工业化食品。
2）特种功能性食品：它着眼于某些特殊消费群的身体状况，强调食品在预防疾病和促进健康方面的调节功能，如减肥功能性食品、提高免疫调节的功能性食品和美容功能性食品等。
（2）根据科技含量分类
1）第一代产品（强化食品）：它是根据各类人群的营养需要，有针对性的将营养素添加到食品中去。举例如：各类强化食品及滋补食品，如高钙奶、益智奶、鳖精、蜂产品、乌骨鸡、螺旋藻等。
2）第二代产品（初级产品）：要求经过人体及动物实验，证实该产品具有某种生理功能。举例如：三株口服液、脑黄金、太太口服液、恒宁固之宝等。
3）第三代产品（高级产品）：不仅需要经过人体及动物实验证明该产品具有某种生理功能，而且需要查清具有该项功能的功效成分，以及该成分的结构、含量、作用机理、在食品中的配伍性和稳定性。举例如：防感宝贝、鱼油、多糖、大豆异黄酮、辅酶Q10、纳豆、金御稳糖等。
功能性食品包括:增强人体体质(增强免疫能力,激活淋巴系统等)的食品防止疾病(高血压、糖尿病、冠心病、便秘和肿瘤等)的食品恢复健康(控制胆固醇、防止血小板凝集、调节造血功能等)的食品调节身体节律(神经中枢、神经末稍、摄取与吸收功能等)的食品和延缓衰老的食品功能性食品中真正起生理作用的成分，称为生理活性成分。富含这些成分的物质则称为功能性食品功能性食品基料或生理活性物质，即功能因子。 已确定的活性物质主要包括9大类，具体品种有上百种。（1）活性多糖 包括膳食纤维、抗肿瘤多糖和降血糖多糖等
（2）内能性甜味料（剂）包括功能性单糖、功能性低聚糖、多远糖醇和强力甜味剂
（3）功能性油脂 包括多不饱和脂肪酸、油脂替代品、磷脂和胆碱等
（4）自由基清除剂 包括非酶类清除剂和酶类清除剂等
（5）维生素 包括维生素A、维生素E和维生素C
（6）微量活性元素 包括硒、锗、铬、铁、铜和锌等
（7）肽与蛋白质 包括谷胱甘肽、降血压肽、促进钙吸收肽、易消化吸收肽和免疫球蛋白等 （8）乳酸菌 特别是双歧杆菌等
（9）其他活性物质 如二十八烷醇、黄酮类化合物，多酚类化合物和皂苷等
市场上常见的功能性食品
自开发功能食品以来，各国各企业热衷研究的课题包括抗衰老食品、抗肿瘤食品、防痴呆食品、糖尿病患者专用食品、心血管病患者专用食品、老年护发食品和护肤食品等。
现在国内市场上主要的功能性食品是针对其作用而生产、销售。常见的有补充微量元素、补血、补钙等。
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