通常情况下，支原体感染具有一定的自限性，若感染数量不多且病情较轻微，人体的免疫系统可对支原体进行清除，感染者往往无明显不适症状，不需治疗。
若支原体感染较为严重，诱发了呼吸道感染、肺炎或生殖处感染，则需进行一定药物治疗，通常用于支原体感染治疗的药品为大环内酯类抗菌药，如红霉素和阿奇霉素等，此类药物可帮助杀灭支原体，但因病情程度和感染类型差异，应服用的具体药品有区别。
对于不同类型的支原体感染，应服用不同药物，比如导致肺炎的支原体感染应服用四环素类药物，而不可用青霉素等抗菌药，具体用药要医生指导，用药错误无法达到清除支原体的目的。
支原体感染若较为轻微，无明显不适症状，可依靠身体免疫自行修复，而引起疾病之后，需药物治疗。大环内酯类抗生素为首选，如红霉素、罗红霉素和阿奇霉素。对大环内酯类不敏感者则可选用呼吸氟喹诺酮类，如左氧氟沙星、莫西沙星等，四环素类也可用于肺炎支原体的治疗。疗程一般2-3周，肺炎支原体无细胞壁，青霉素或头孢类抗生素无效。对剧烈呛咳者，应适当给予镇咳药。
支原体是呼吸道慢性传染病、会造成呼吸困难、可以用红霉素、罗红霉素、阿奇霉素、阿莫西林、等药治疗会有效。
红霉素，临床主要应用于链球菌引起的扁桃体炎、猩红热、白喉及带菌者、淋病、李斯特菌病、肺炎链球菌下呼吸道感染（以上适用于不耐青霉素的患者对于军团菌肺炎和支原体肺炎，本品可作为首选药应用。尚可应用于流感杆菌引起的上呼吸道感染、金黄色葡萄球菌皮肤及软组织感染、梅毒、肠道阿米巴病等。
本品是大环内酯类抗生素，由菲宾Panay岛上壤中分离的放线菌Streptomyces erythreus培养液中制成，1952年EliLilly公司首次发表。培养液中同时产生红霉素B及C等几种类似体，利用其对溶剂溶解度的不同加以除去。
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