生殖器官感染
男性生殖器官感染病原菌后，炎症的存在会影响性腺的正常分泌和生精功能的下降，使精子的形态改变、活力和存活期降低，从而丧失受精能力，导致不育。大多数患者会出现急性睾丸炎、附睾炎、前列腺炎、尿道炎、生殖器官结构异常等症状。
精索静脉曲张
精索腱静脉丛的扩张会使睾丸血流受阻，温度升高，引起代谢紊乱。另外，有害物质不能及时排出，会造成睾丸生精障碍，导致少精、精子畸形、活力下降，从而导致不育。
内分泌功能紊乱
内分泌功能障碍包括下丘脑、垂体功能障碍和甲状腺功能减退，可引起促性腺激素分泌异常，影响睾丸功能，导致不育。
性功能障碍
包括勃起功能障碍、早泄、性欲减退、射精障碍，这些都是导致不孕的重要原因。勃起功能障碍是指阴茎不举或不坚挺，不能插入阴道完成性交。但不射精或逆行射精是指即使有性交，也没有足够的精液进入阴道，精子和卵子无法相遇结合。
生殖器官发育异常
会导致阴茎难以插入阴道，精液无法正常注入阴道，导致不孕。常见的阴茎缺损，小阴茎，大阴茎，重度尿道下裂等。另外，睾丸发育异常会导致生精障碍，进而导致不育。
遗传性疾病
先天性疾病的病因复杂，包括遗传因素、环境因素、辐射、化学物质、内分泌失调、妊娠早期风疹病毒感染等。这些致病因素主要影响妊娠前三个月胚胎的发育。
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