复旦大学附属
中山医院：擅长肝癌的综合治疗、心血管病、呼吸内科，尤其是肝移植全国领先。
华山医院：以神经外科、神经内科、皮肤科、骨科（尤其是手外科）为特长，江苏路分部是乳腺专科。
华东医院：老年病特色。
复旦大学附属儿科医院：主体已搬到闵行区顾戴路，小儿外科国内知名，分离过多例连体婴儿。
复旦大学附属肿瘤医院：肿瘤科、病理科沪上领先。
复旦大学附属眼耳鼻喉科医院（五官科医院）：眼科、眼视光、眼外伤、耳鼻喉各种疾病。
复旦大学附属妇产科医院（红房子医院）：不孕不育。
复旦大学附属公共卫生临床中心：原来的上海市传染病医院，收治各种法定传染病。
上海交通大学医学院附属
瑞金医院：血液科、烧伤科、内分泌科最强，肾脏科、消化科、感染科也在沪上前列。
仁济医院：以消化内科、风湿免疫科、神经外科、妇产科见长，也是上海人类精子库所在地。
新华医院：综合性医院，但儿科名扬全国，小儿心血管、小儿血液、小儿外科等在全国一流，水平远高于儿童专科医院。成人方面，心血管、消化、神经内科为重点学科。
上海儿童医学中心：新华医院下属的儿童专科医院，擅长儿童先天性心脏病手术。
上海交大附属上海市儿童医院：静安区北京西路，在普陀区建有新院，遗传病、小儿泌尿较有优势。
上海市第一人民医院：眼科、眼底病、中医消化病、泌尿外科、心外科、器官移植处于前列。
上海市第六人民医院：在糖尿病、断肢再植（骨显微外科）、超声医学等领域名扬全国。
上海市第九人民医院：以口腔科、整复外科、关节外科为重点，是整形领域的领头羊。
上海交大附属上海市胸科医院，徐家汇附近，在肺癌、心肺功能障碍、胸部积水等方面实力强。
上海市精神卫生中心：下属上海市心理咨询中心，精神疾病、心理咨询等方面实力不错。
国际和平妇幼保健院：徐家汇衡山路，开展试管婴儿，不孕不育、妇女保健较强。
上海中医药大学附属
龙华医院：擅长中医治疗恶性肿瘤、骨退行性病变、肾病、风湿病、乳腺病、脾胃病、呼吸病等，其中以中医外科和中医肿瘤最为出名。
曙光医院：卢湾和浦东张江都有，擅长中医肝病、骨伤科、中医肾病、糖尿病、脾胃病。
岳阳中西医结合医院：针灸推拿、中医妇科、中医血液科比较好。
市中医医院，位于闸北区芷江中路，中医儿科、中医失眠症、中医红斑狼疮等有特色。
第二军医大学附属
长海医院：杨浦区长海路，形成肝胆外科、胸心外科、烧伤外科、血管外科、血液内科、消化内科等特色学科。
长征医院：颈椎病、脊柱病的手术（脊柱外科）全国有名，形成骨科、神经外科、器官移植、肾病、皮肤真菌病、多发伤救治等特色。
东方肝胆外科医院：肝脏肿瘤、介入治疗，复杂胆道手术以及肝移植等方面居国内先进水平。
同济大学附属
同济医院：原名甘泉医院，并入同济大学后才得以真正发展，心内科、精神医学科稍好。
上海市肺科医院：肺移植技术熟练，在职业病、肺部肿瘤、肺气肿等领域领先。
同济大学口腔医院：上海唯一三甲口腔医院，但不如九院的口腔科名气大。
上海市第十人民医院：中医心脑血管病、视觉复明、创伤急救处于上海市内领先地位。
同济大学附属第一妇婴保健院：产前诊断、围产医学较强。
分医院详细介绍，请点击
上海有没有一流的医院，它们的专长是什么？ - 黄药子的回答
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