令患者取平卧位，饮下用核素标定的实验餐，在闪烁照相机下进行扫描，以定量地发现胃食管反流，此项技术即为核素扫描。核素是用99mTc。扫描时采用一些促使反流的方法，如Valsalva试验和腹部缚腹带以加压。根据胃和食管内的核素含量来确定有无反流，由电脑进行分析。
此项检查的优点是非侵害性，患者放射性接触很微量，不需长时间监测，很快便可得到检查结果。因为是观察食管、胃的机械功能和测量反流物的容积，又因为餐后胃酸被食物中和，而核素扫描能发现餐后的反流，所以此项技术是一项与酸无关的试验。Shay（1991）报告核素扫描能发现61%的餐后反流，而pH监测只能发现15%的餐后反流。
核素扫描的不足之处是其敏感性和特异性仍不够高。目前此检查多被pH监测所取代，但在疑为非酸性反流的情况下，尚有一定用途。
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