引起肝囊肿的原因主要可以分为两种情况，一种是寄生虫性肝囊肿，一种是非寄生虫性肝囊肿。寄生虫性肝囊肿，发病的原因主要是和日常的饮食习惯有关系的。因为饮食的不注意导致棘球蚴绦虫卵进入人体，之后在人体的肠道中孵化了一些幼虫，而这些幼虫之后会进入人体的血液并到肝脏中从而发育成虫。这个时候肝脏就形成了蜂窝状的一个形态，其实这就是寄生虫性肝囊肿。
非寄生虫性肝囊肿有两种情况的表现，一种是潴留性肝囊肿，一种是先天性肝脓肿。潴留性肝囊肿所引起的原因主要还是因为人体的胆小管出现一些炎症问题或者是水肿、结石等，从而导致人体胆汁分泌出现增多的情况。这个情况随着时间的积累慢慢的就形成了胆汁潴留，从而就引起了潴留性肝囊肿疾病。
不过，大部分潴留性肝囊肿是属于单发性状态的，主要表现的情况是囊肿内部会出现胆汁还有血液的情况。并且，囊肿外层会被一些薄膜状一样的相关纤维组织所包裹。此外，要是有结石梗阻以及胆管炎的刺激的话，这是会导致肝囊肿内部的胆管囊出现扩大的情况，不过胆汁潴留性肝囊肿里面全部都是胆汁。
先天性肝囊肿一般发病的原因是在胎儿阶段形成的。其实就是胎儿的淋巴管处于发育的状态出现了障碍，另外肝内胆管也出现了障碍，或者是在胎儿发育的时候患上了胆管炎，从而就会导致胆管闭塞，进而引起近端囊性扩大的情况，之后就会导致局部增生堵塞，从而形成了先天性肝囊肿。
肝囊肿不是肿瘤，因此一般不会发生恶变等一些情况。不过肝囊肿会长大，但生长也比较缓慢，一般是不会有什么症状的。通常是可以通过B超、CT检查或者是肝扫描器等一些方式来诊断是否存在肝囊肿情况。肝囊肿目前是没有什么药物能让囊肿缩小或者消失。因此可以说肝囊肿是终身携带的，除非是肝囊肿特别大或者伴有一些特别严重的合并症的时候，北京四惠西区医院中医肿瘤专家王ze 民主任说这个时候才需要通过一些外科手术或者是引流的方式进行治疗。肝囊肿患者在平时可以多锻炼身体，提高身体免疫能力，这样在一定程度上能减缓肝囊肿的增长。
有一部分是有家族遗传，很多都是先天发育而成的有一些后天形成，可能是分泌小管的堵塞。一般小的囊肿没有症状可以定期观察，暂不需要治疗，如果囊肿较大伴有压迫或感染疼痛症状可以行手术治疗。中医认为肝肾囊肿的病因可能与肝肾阴虚、肝胆湿热、肾阳不足、肝郁气滞、气滞血瘀、气郁食积等有关。中医讲究辨证论证，根据患者表现于外的征象，结合望闻问切四诊法，判断内在的病变。按中医辨病，肝肾囊肿属于症瘕、鼓胀等疾病范畴。辨证论治，虚者补之，实者泄之。 1、肝肾囊肿大多是先天性的，也有单发的，也可多发的，有时肝、肾囊肿同时存在，一般说肝肾囊肿对人体健康没有多大影响。2、过大的肝肾囊肿。对脏器其本身或周围的器官可形成压迫症状或有炎症，可用针吸治疗或手术减压治疗，炎症时要用抗菌药物治疗。
3、不形成压迫的肝、肾囊肿可以不予治疗，亦无有效治疗措施。
4、掌纹诊断肝、肾囊肿十分可靠，一般不必做更多的检查。
5、可以正常工作和生活，较大的肝、肾囊肿，则应注意避免局部外伤。
6、肝、肾囊肿一般发展缓慢，不会癌变，预后良好。
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