在生殖内分泌以及不孕不育的人群中，大部分是由于遗传因素导致的，其中可以分为染色体病、单基因病以及复杂性多基因病。虽然遗传检测技术日新月异，但染色体检查仍然是最基本的检测指标，当人类的精子与卵子结合成为受精卵时，生命也会随之诞生，且承担着父母双亲各自的共同的遗传信息。
决定性别的染色体称为性染色体，男性由X染色体以及Y染色体组成，女性由两个X染色体组成，其余的22对染色体称为常染色体。X和Y控制性别，22对染色体控制其余的遗传特征。
染色体检查是用外周血在显微镜下观察染色体的结构和数量。正常男性的染色体核型为44条常染色体加2条性染色体X和Y，检查报告中常用46，XY来表示。正常女性的常染色体与男性相同，性染色体为2条 XX，常用46，XX表示。46表示染色体的总数目，大于或小于46都属于染色体的数目异常。缺失的性染色体常用O来表示。第一个是常规检查：是测定男性生育力的最根本，最主要的临床指标，有关的参数是医生最先需要调查的。
第二个是精浆生化检查：进行分析有利于对附睾，前列腺，精囊腺功能的了解。
第三个是连累微生物检查：男性泌尿，生殖系统感染经常导致男性不育，与男性泌尿，生殖系统感染有关的病原微生物有细菌，病毒，螺旋体，支原体，衣原体等，常见有淋球菌，状瘤病毒，腺原体，沙眼衣原体等。
第四个是内分泌检查：检测男性的性功能和生殖功能，是男性不育症的一个主要原因，内分泌检查主要是有关性激素T，FSH，LH，PRL，E2的测绘和各种煽风试验，如HCG刺激试验等。最后一个是遗传学检查生活护理。
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