诊疗科室30余个，妇产科被列为卫生厅省市共建学科。妇产科、心血管内科、泌尿外科、肿瘤外科、儿科、功能检查科被列为吉安市医学领先学科，神经内科、肾内科、消化内科、神经外科为全市医学重点学科，眼科、心胸外科为我院重点发展科室，中医科为吉安市中医名科、吉安市中医药学会风湿病科研基地,前列腺疾病诊治、乳腺癌根治、变态反应皮肤试验、超声介入为吉安市特色专科。
吉安市第二人民医院创建于1973年，是一所二级综合性非营利性医院。 科室设置有预防保健、全科医疗科、内科、外科、中医科、妇科、妇女保健科、儿科、小儿外科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、医疗美容科、肿瘤科、急诊医学科、康复医学科、感染科、疼痛科、肛肠科、麻醉科等21个临床大科室和56个专业学科。这是医院的介绍，谢谢
院内设有江西省眼科中心、江西省临床检验中心、江西省保健体检中心、江西省心血管病研究所、江西省神经病学研究所、江西省干细胞研究重点实验室、江西省颌面整形与再造重点实验室、江西省肾脏病重点实验室、江西省血液肿瘤细胞生物学重点实验室、博士后科研工作站、临床医学研究所、老年病研究所、国家药物临床试验机构等，同时还是卫生部冠心病介入诊疗、先心病介入治疗和心律失常介入诊疗（导管消融和植入器械）培训基地、器官移植专业和抗肿瘤药物专业临床药师培训基地，脑卒中筛查基地，江西省专科医生培训基地，第二军医大学、南昌大学医学院等院校的教学基地，并与中国人民解放军总医院、日本九州大学病院、台湾长庚医院建立协作关系。
神经内科专业为“国家临床重点专科”心血管介入、眼科、器官移植科、病理科、整形颌面外科（唇腭裂）专业和老年医学科为“全省医学领先专业”。呼吸内科，消化内科、心内科、ICU和护理专科成为“省级临床重点专科建设项目”。眼科、临检中心、病理科、肾病学、冠心病介入和省健康管理（体检）为全省医疗质量控制中心。器官移植科、神经内科、血液内科、神经外科、骨科、肾内科、呼吸内科、重症医学科等专业优势明显，在省内具有重要的影响，开展的器官移植、心血管介入治疗、微创和显微外科手术等高新技术均走在全省前列。成功开展了心脏移植、骨髓移植、肝肾、肝胰联合移植、亲属活体供肝肝移植术、冠状动脉搭桥术、脑干、脊髓髓内肿瘤摘除术、心脏及外周血管介入手术、面肌痉挛和三叉神经手术、多学科腹腔镜手术及遗传病的基因治疗、干细胞治疗等。
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