1、适当的吃调节肠道菌群的药物，以及调节肠道神经功能的药物给予治疗，比如调节肠道菌群的药物，可以使用蜡样芽孢杆菌、复合乳酸菌等等，而调节肠道神经功能的药物，可以选择马来酸曲美布汀等等。
2、如果患者是因为情绪紧张、精神焦虑、抑郁等导致的肠胃不好，必要时还需要抗焦虑、抗抑郁治疗。
3、如果患者的肠胃不好是因为细菌感染所引起，需要完善药物的敏感试验，必要时还需要使用抗生素给予治疗，比如头孢类抗生素、氨基糖苷类抗生素等等。
治疗胃部疾病的用药主要有抑制胃酸分泌的药物、保护胃黏膜的药物、促进胃动力的药物，有感染的患者还需要进行抗生素的治疗，具体如下：1、抑制胃酸分泌的药物首选质子泵抑制剂，通常用的有奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑等。此外抑制胃酸分泌还有H2受体拮抗剂，常用的药物有法莫替丁、尼扎替丁、雷尼替丁等。这两种药物主要是针对有胃溃疡的患者能够有效控制症状，促进溃疡的愈合。2、保护胃黏膜的药物目前主要有铋剂和弱碱性抗酸剂，常用的有枸橼酸铋钾、铝碳酸镁、硫糖铝、氢氧化铝凝胶等，这类药物可以中和胃酸，缓解疼痛。3、胃动力不足的可用增加胃动力的药物。4、对于有胃炎的患者或者幽门螺杆菌感染的患者，要进行抗生素的联合治疗控制感染，根治幽门螺杆菌。具体的用药最好去医院由专业医生进行指导用药。出现上腹隐痛、不适，伴有反酸、烧心症状或者上腹隐痛不适，于餐后明显缓解时，多考虑症状的发生与胃酸相关，此时可考虑服用铝碳酸镁等抗酸药物，以及奥美拉唑肠溶胶囊等抑制胃酸药物对症治疗。当出现上腹胀满、嗳气、纳差以及腹泻、便秘等症状时，患者常表述为肠胃不好。常见引起上述症状的疾病，主要包括慢性胃炎、消化性溃疡病以及肠易激综合征等功能性肠病。当发生上述症状时，为缓解症状可进行相应的对症治疗，如出现腹胀、便秘等症状时，可考虑口服促胃动力药物、通便药物进行对症治疗；出现腹泻症状时，则可服用肠道益生菌、消化酶等药物对症治疗。
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