经省卫生厅等有关上级部门批准，医院内设18个研究中心及研究室：
1.云南省临床检验中心；
2.云南省围产医学生殖遗传研究中心；
3.云南省肠内、肠外营养研究中心；
4.云南省临床分子生物学研究中心；
5.云南省血液病学临床研究中心；
6.云南省生殖医学研究中心；
7.云南省消化内镜研究中心；
8.云南省神经与精神医学研究所脑血管康复研究室；
9.云南省肝胆胰外科临床研究中心肝胆研究室；
10.云南省医学影像临床应用研究中心医学影像诊断研究室；
11.云南省胃肠动力研究室；
12.云南省肺癌临床治疗中心；
13.云南省临床外科微创中心；
14.云南省呼吸疾病诊治中心；
15.云南省产前诊断中心；
16.云南省乳腺疾病普查普治项目治疗中心；
17. 云南省第一人民医院肿瘤综合治疗中心；
18.云南省第一人民医院司法鉴定中心。医院为云南省首家经卫生部批准开展体外受精-胚胎移植、卵胞浆内单精子显微注射技术和供精人工授精技术的医院；在省内首家、国内第四家取得卫生部颁发的临床基因扩增检验实验室技术验收合格证书。建立了技术水平一流的遗传诊断中心实验室、临床基础医学研究实验室
特色专科：医院设有52个医疗业务科室，其中呼吸内科、血液内科、内分泌科、心血管内科、神经内科、肝胆外科、胸心外科、普外科、骨科、眼科、耳鼻喉科、生殖遗传科等12个科室是省内重点专科；每年用600万元扶持院级优势学科12个。近3年来，开展新业务、新技术300余项，有的项目达到国内先进水平或填补了省内空白，试管婴儿技术的应用与发展居我省领先、国内先进水平，在器官移植领域取得突破，成为我省能够进行肢体及多种器官移植的医院。3年来共获各类科技成果奖50余项、发表论文1360余篇。
医院拥有德国西门子公司直线加速器、两排螺旋CT、十六排螺旋CT、六十四排双源螺旋CT、1.5T超导磁共振仪、3.0T超导磁共振仪、双C臂造影设备及介入治疗系统、数字化胃肠X线诊断系统，全自动生化分析仪，全自动电化学发光免疫分析仪，全自动基因分析仪，全数字编码彩色超声诊断仪、彩色多谱勒超声诊断仪、DR数字化X光机、全数字化乳腺机、STE/CT单光子发射计算机断层r显像仪等数百台（套）。
云南省第一人民医院(昆华医院)生殖遗传科科主任.生殖中心主任章晓梅，女，1943年6月30日出生。云南省人类辅助生殖技术知名专家。1966年昆明医学院医疗系本科毕业，1981年中国医科大学妇产科硕士研究生毕业，并获医学硕士学位，同年分配到云南省第一人民医院工作至今。1988年至1990年两次到日本进修学习，多次参加国内外生殖医学方面学术交流。1995年起，担任云南省第一人民医院生殖遗传科科主任.生殖中心主任。现任昆明医学院教授.昆明医学院硕士研究生导师，中华医学会计划生育学会委员，云南省计划生育专科学会名誉主任委员，云南省医学遗传学专科学会委员，云南省中西医结合学会妇科分会委员，生殖学会委员，云南省优生优育协会理事，云南省计划生育专家组成员，云南省母婴保健技术鉴定委员会委员。中华医学会生殖医学会委员。 擅长于生殖内分泌.不孕症诊治.促排卵技术.试管婴儿及人工授精技术.杜玉堂教授，1965年北医大6年制医疗系毕业，现任全国中西医结合乳腺病协作组组长，全国中医乳腺病专业委员会副主任委员。主持部级科研题目——手诊的研究，通过此项研究要使手诊能登大雅之堂，正式成为中医望诊的重要组成部分,已完成。
1996年任中国中医研究院特色医药合作中心主任。
1999年10月反聘北京中医药大学东方医院，重建乳腺科。
2013年1月任北京北海医院乳腺科首席会诊教授。
2013年8月17日，第十届全国乳腺微创与功能治疗学术会议 在辽宁省大连市开幕。会议由中华医学会外科分会、中华医学会继续教育部和首都医科大学附属复兴医院主办。北京北海医院乳腺外科医学中心由杜玉堂教授率队，应邀出席了会议，并就在浆细胞性乳腺炎领域取得的医疗成果进行了探讨与分享，为今后我国的浆乳治疗提供了新的思路。
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