慢性期经过数月或数年之后，恶性造血干细胞极度增生，骨髓原粒+早幼粒细胞≥20%，可伴由血小板衍生生长因子过多引起的骨髓纤维化改变，每个病人何时急变尚不能预测，一旦发生急变，病情迅速恶化，治疗非常困难，存活期很少超过6～12个月。
(1)症状：有不明原因的发热，脾进一步肿大出现骨痛，出血以及髓外肿物等浸润现象，如淋巴结肿大，皮肤软组织肿块或溶骨性病变。
表现与急性白血病类似，多数为急粒变，少数为急淋变和急单变。高烧持续不退，除加速期以外症状，脾脏明显肿大，骨、关节疼痛加重，皮肤出现结节，骨髓原始细胞大于30%，并可有异形变，即可转化为急淋、急粒单、急单、急性巨核细胞白血病和急性红白血病等。急变期：具下列之一者可诊断为本期。① 原始细胞(Ⅰ型+Ⅱ型)或原淋+幼淋，或原单+幼单在外周血或骨髓中>=20%。
② 外周血中原始粒+早幼粒细胞>=30%。
③ 骨髓中原始粒+早幼粒细胞>=50%。
④ 有髓外原始细胞浸润。
⑤ CFU-GM培养呈小簇生长或不生长。
晚期当血小板减少时皮肤、齿龈易出血，女性可有月经过多。
慢粒性白血病细胞侵犯人体的各个脏器造成损害，如侵犯肝、脾和淋巴结时，出现肝、脾和淋巴结的肿大脑和脑膜受到白血病细胞侵犯时，出现头晕、头痛、嗜睡、意识模糊不清，也可出现抽筋、肢体瘫痪、排尿困难侵犯肾脏可出现肾功能受损侵犯睾丸或卵巢时，可出现性功能异常。
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