
用float:left让li横向展开, 可以设置右边框为直线, 最后一个不设置右边框即可
代码如下
<style>
li{float:leftborder-right:1px solid #CCCCCCpadding:0 14pxlist-style:none}
li.last{border-right:none}
</style>
</head>
<body>
<ul>
<li>1111111111</li>
<li>222222222222</li>
<li>3333333333</li>
<li>444444444</li>
<li>5555555555</li>
<li class="last">6666666</li>
</ul>
</body>
将gff转变为bed格式
获取对应cds/pep序列
也可以根据gff文件,基因组ref.fa文件中直接调取cds,和pep序列
得到以下图片
若想突出显示某一共线性则可以在对应的位置添加g *即可
若想比较3个物种共线性关系,则应两两比对,得到两个.simple文件,并对其进行配置
可以得到以下结果
也可以调整配置文件,得到不同样式的图形
得到如下结果
除此之外,可以用TBtools快速得到共线性图片可以参考 用TBtools,快速高效实现基因组共线性分析与可视化, 赞!
在基因水平上进行查看共线性结果
(1)获取共线性区块
grape.peach.i1.blocks 包含两列 (iter=1),第一列grape基因名字,第二列;peach基因名,么有对应基因就是一个点
本次选择部分进行画图
(2)配置画图 blocks.layout
(3) 进行画图
也可以选择直线
基因也可以只用箭头的方式
也可以添加颜色
添加基因名称
也可以多个进行比对(如上述一样)
首先俩俩进行比对,分别获取block,然后将其合并即可
block 文件如下
blocks2.layout如下
开始画
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