igraph:为什么add_edge函数比add_edges这么慢?

igraph:为什么add_edge函数比add_edges这么慢?,第1张

igraph:为什么add_edge函数比add_edges这么慢?

原因是igraph在C层中使用索引边缘列表作为其数据结构。索引使得可以在恒定时间内查询特定顶点的邻居。如果您的图形很少更改,则很好,但是当修改 *** 作比查询频繁得多时,它就会成为负担,因为无论何时添加或删除边,都必须更新索引。因此,每次调用

add_edge
都会使igraph重新为其内部数据结构编制索引。好处是,如果您仍然必须重建索引,则可以
add_edges
以几乎相同的成本添加许多边。因此,在第一个代码示例中,索引重建了30000次,而在第二个示例中,索引仅重建了一次。

顺便说一句,您可以使用来更快地完成工作

Graph.Erdos_Renyi(n=10000, m=30000)



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