
无论是工作中使用还是应付各种面试,linux sort 都是必须要掌握的 linux 基本命令之一。尤其是 linux sort -k 命令,经常会被搞晕,索性好好研究一下 sort 命令
语法:
选项:
参数就不一一介绍了,直接上例子,首先先看下原始的排序数据
cat sort.log
1、打印从哪列开始是乱序
sort -c sort.logecho $?
sort -C sort.logecho $?
其中,返回结果 1,表示文件不是已经排序好的文件
2、默认排序( 整行进行ASCII字符升序)
sort sort.log
3、高能来了,让人迷糊的 k 语法,首先看下 k 的语法格式
这个语法格式可以被其中的逗号(”,”)分为两大部分,Start部分和End部分
Start和End部分都由三部分组成,其中的Modifier部分就是类似n和r的选项部分,可省略
FStart、Fend,表示使用的域,而CStart则表示在FStart域中从第几个字符开始算"排序首字符",同理,CEnd表示结尾的第几个字符是排序末尾字符,.CStart、.CEnd是可以省略的,分别表示从本域的开头部分开始、到本域的域尾结束,CEnd设定为0,也是表示结尾到域尾。口说无凭,上几个例子吧
3.1 对第三列进行排序,如果不加n,按照 ASCII字符排序
sort -t $'\t' -k 3 sort.log
3.2 加n后,按照数值排序
sort -t $'\t' -k 3n sort.log
3.3 不指定 FEnd 时,多个 -k 从前往后排序可以,从后往前不行
从后往前,多个 -k,数据符合预期
sort -t $'\t' -k 3n -k 1 sort.log
从后往前,多个 -k ,第三列相同时,按照第一列降序排列,数据符合预期
sort -t $'\t' -k 3n -k 1r sort.log
更换成从前往后
sort -t $'\t' -k 1 -k 3n sort.log
sort -t $'\t' -k 1 -k 3nr sort.log
通过 sort -t $'\t' -k 1 -k 3n sort.log 和 sort -t $'\t' -k 1 -k 3nr sort.log 返回的结果发现,在第一列相等时,无论其三列是正序排列,还是逆序排列,结果都一样,说明后边的 -k 未生效
当指定 FEend 后
sort -t $'\t' -k 1,1 -k 3nr sort.log
3.4 作用域
紧跟在字段后的选项(如"-k3n"的"n"和"-k2nr"的"n","r")称为私有选项,使用短横线写在字段外的选项(如"-n"、"-r")为全局选项。当没有为字段分配私有选项时,该排序字段将继承全局选项,所有选项包括但不限于"bfnrhM"
除了"b"选项外,其余选项无论是指定在FStart还是FEnd中都是等价的,对于"b"选项,指定在FStart则作用于FStart,指定在FEnd则作用于FEnd
sort -t $'\t' -k1r,2 sort.log ,可以看出一、二列都是倒叙排列
3.5 注意
指定n选项按数值排序时, 由于"n"选项只能识别数字和负号"-",当排序时遇到无法识别字符时,将导致该key的排序立即结束,n选项绝对不会跨域进行比较
默认情况下,sort会进行一次 "最后的排序" ,按照默认规则对整行进行一次排序,这次排序称为"最后的排序"
sort -t $'\t' -k3n sort.log ,在第三列相等时,整行会按照 ASCII 进行最后的升序排列
sort -t $'\t' -k3,4n -s sort.log ,加了 -s 后,不会进行最后的排序(1000相同时,e在b的前边了),而是保留原排序
3.6 按照某个域中的第n个字符进行排序
sort -t $'\t' -k2.3,2.3 sort.log ,按第二列第三个字符进行排序
4、 -h 使用易读性数字(例如:2K、1G)
sort -t $'\t' -k5h sort.log
sort -t $'\t' -k2,2 sort.log|uniq
sort -t $'\t' -k2,2 -u sort.log 会对第二列进行去重,而 sort -t $'\t' -k2,2 sort.log|uniq 会对整行进行去重(当然uniq也可以按照第二列进行去重)
sort整理完了,欢迎大牛指教
1、sort 用法参数有 -urontk
-u 去重
-r 降序
-o 标准输出
-n 换数字排序
-t 指定分隔符
-k 指定以第列来排序
-f会将小写字母都转换为大写字母来进行比较,亦即忽略大小写
-c会检查文件是否已排好序,如果乱序,则输出第一个乱序的行的相关信息,最后返回1
-C会检查文件是否已排好序,如果乱序,不输出内容,仅返回1
-M会以月份来排序,比如JAN小于FEB等等
-b会忽略每一行前面的所有空白部分,从第一个可见字符开始比较。
2、所以主要用到了-t 与-k参数
# ls |sort -t "_" -k 3PM25D7_R1_L1_L3_107-1-2-9.1.fq.gz
PM25D7_R2_L1_L3_107-1-2-9.2.fq.gz
PM25D7_single_L1_L3_107-1-2-9.single.fq.gz
PM25D7_R1_L2_L4_107-1-2-9.1.fq.gz
PM25D7_R2_L2_L4_107-1-2-9.2.fq.gz
PM25D7_single_L2_L4_107-1-2-9.single.fq.gz
sort命令是对文件进行排序,并将排序的结果输出到屏幕,不影响原文件以行为单位,将每一行作为一个单位,相互比较,比较原则是从首字符向后,以此按ASCII码进行比较,最后升序输出
参数
-b 忽略每行前面开始处的空格
-d 只按照英文字母,数字,空格字符排序,忽略其他字符
-m 将几个排序好的文件进行合并
-n 依照数值的大小进行排序,如果是按照数值大小排序一定要加 -n ,否则就会出现 10 比2 小的情况,因为默认比较数值是先比较第1位的,后面的位不考虑
-o 将排序好的结果输出到文件, 也可以使用重定向符号 输出到文件中
-r 以相反的顺序来排序, 默认是升序
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