WB相关技巧--quantity one软件调节内参

WB相关技巧--quantity one软件调节内参,第1张

1.跑WB 有时候不想做PCA定量怎么调节内参呢? 

解答:有老司机认为凭借经验可以用肉眼看出来差异,可是对于新手来说总不能做个几百次才像他们获得经验吧,这时候定量就是急需的内容了,对不对? 解决方法呢?   一般可以用image J 软件或者quantity one软件进行 *** 作, 原理为 :image J 是依据灰度值(也就是白色到黑色的颜色变化程度)进行的调节;quantity one是依据密度或者体积(也就是条带的大小); 结果: quantity one 貌似用体积方法好用一点点。

流程如下:打开quantity one 软件 之后导入图片(tiff文件,之前试跑的条带),

结果为:

使用quantity one 进行蛋白的相对含量分析比较的方法: 

先将DGGE图片用画图软件转成TIF格式,加载进QuantityOne后点工具栏上的LaneTools,找到createlanesinanadjustableframe这个工具。

在DGGE图谱上添加可以看见的每个泳带,添加完了在match下面找到match匹配,匹配好了后在reports找到phylogenetictree就可以进行聚类分析了,里面自己选择不同的聚类分析方法。

蛋白质分析法

主要是通过蛋白质含量测定来计算MT浓度,免疫法是最主要的方法。它尤其适合于微量检测,具有灵敏、特异的特点,灵敏度在pg/ml级,对存在体液中含量甚微的MT具有较好的检测效果。在近些年,先后建立了Western Blotting法、放射性免疫检测法(RIA)和酶联免疫吸附法(ELISA)。

以上内容参考:百度百科-蛋白质分析法

是的,quantityone和imagej测的灰度值有区别。quantityone使用8位灰度级来测量图像的灰度,它的灰度可以范围从0到255,每一个灰度值都对应了不同的颜色;而imagej使用16位灰度级,它的灰度可以范围从0到65535,比quantityone更加细致,可以更加准确地表示图像的灰度。


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