请教关于TCGA数据的问题_工具

Case列显示的是该文件里数据来自于多少cases。比如569，说明这个文件整合了所有569个cases的genotyping数据，有些数字为1的，说明这个文件里只有一个case的数据。

对于RNAseq后续的分析，如果要用软件比如limma，edgeR比较表达差异的基因，就用counts数据。如果你想自己做t-test，下载counts数据自己做normalization再进行比较也行，或者下载已经做过normalization的RPKM/RPKM-UQ直接比较也行

癌旁的数据也包含在这些cases里了，下载metadata就能看到每个sample的信息，你会发现有些是来自solid tissue normal，这些都是癌旁的数据

数据库中的外码

1外码是另外⼀个表的主码;

2插⼊数据是必须先给所关联外码的那个表插⼊数据；

3报错的原因是插⼊的某个属性在所关联外码表中找不到。

外码的意义是：保证两个表之间的数据的⼀致性，例如：职⼯表中的部门号，必须在部门表中存在。create table 部门(

部门号 char(20) primary key not null,

名称 char(20) constraint UK_dName unique not null ,

经理名 char(20),

第 1 页

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地址 varchar(20),

电话号码 char(20)

)

drop table 部门

create table 职⼯(

职⼯号 char(20) primary key,

姓名 char(20) not null,

年龄 smallint check (年龄>=18 and 年龄<=60),

职务 char(20),

⼯资 int not null check(⼯资>=800),

部门号 char(20)

第 2 页

FOREIGN KEY (部门号) REFERENCES 部门(部门号)--直接建⽴外码

)

drop table 职⼯

--新增关系表属性

--新增表的外码

--⽅法⼆：

alter table 职⼯

add constraint S_worker

foreign key(部门号)

references 部门(部门号)

第 3 页

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