转录组差异基因表达的nr注释是什么意思

NR是一个数据库，是NCBI中蛋白质数据库，集合了许多其他数据库中的蛋白质的注释信息。差异基因注释简单来说就是把有表达差异的Unigene的物种、分子功能、生物学途径等等信息通过从数据库中比对，得到的结果。

蛋白水平

单基因分析singlegeneanalysis

检索框输入目的基因→GOPIA→单基因分析模块

总览（general）

提供基因基本信息以及其他门户、人体组织表达分布；泛癌差异表达散点图、柱状图；基因的不同转录本和相似基因表（与XX基因共表达相关性最高的基因）。

差异表达基因分析（DifferentialGenes）

点击左侧导航栏DifferentialGenes→选择瘤种、差异表达基因界值、最小单位、表达上调还是下调、list还是plot。

基因芯片只能根据已有的基因组信心，然后设计探针，检测样本中的差异表达基因，基因组信息一般是来源于国际上几个比较大的数据库，所以不可以检测未知DNA碱基序列,D答案明显错啦。对于未知DNA序列只能通过高通量测序，目前普遍使用的是二代测序，不过第三代测序也快出来了 。

因为GEO是基因表达综合数据库，RNA是实现遗传信息在蛋白质中的表达。

从GEO数据库获取GSE79973数据集，该数据集包含胃癌疾病与正常样本的表达谱数据，筛选出其中差异表达的lncRNA。

下载GSE62254和GSE15459数据集以及对应的临床数据，通过GSE62254数据集来构建一个临床预测模型，识别出与预后显著相关的lncRNA，通过GSE15459数据集对模型进行验证。

进一步的通过多因素分析来研究ACJJ分期、性别、年龄和样本的风险分数与临床预后的关系。最后通过ssGSEA来发现样本的高低风险组之间通路富集的差异情况。

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