求高人指教，关于生物信息学中NCBI数据库的blastn的用法.

你进了NCBI的blast页面之后，粘贴进去序列，下面的program selection 选择第三个。结果中有一个“Gallus gallus”，即是家鸡了（应该是从上面数第二个结果）。

一般的引物设计可以使用primer

5进行设计，将你的目标序列拷贝到软件里，然后根据你的需要搜索出最佳评分的引物。如果是需要表达的基因片段，可能会需要顶头设计，即从两端抄写20bp左右的序列，然后可以根据情况延长或缩减，尽量避免引物二聚体、发卡结构、错误引发之类的。

并不是所有的引物设计之前都需要进行blast比对，blast主要目的是与数据库里面的数据进行比对，以确定序列是哪种基因的序列，或者序列的对错。

一般的，当我们使用BLAST（是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序）时，我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢？

S值表示两序列的同源性，分值越高表明它们之间相似的程度越大。

E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下，其它序列与目标序列相似度要大于这条显示的序列的可能性。所以它的分值越低越好。

E值的计算：

E=Kmn(e-lambdaS)

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