
一、Elsevier(sciencedirect)是荷兰一家全球著名的学术期刊出版商,每年出版大量的学术图书和期刊,大部分期刊被SCI、SSCI、EI收录,是世界上公认的高品位学术期刊。scienceDirect是爱思唯尔公司的全文数据库平台,是全球最大的科学、技术与医学全文电子资源数据库,提供2500余种学术期刊以及37000余种图书的全文内容。包括全球影响力极高的CELL《细胞杂志》、THE LANCET《柳叶刀杂志》等。
二、Embase数据库是Elsevier旗下综合医学信息检索平台。前身为“荷兰医学文摘”。包含源自8300种期刊的4200万条生物医学记录,来自每年7,000个会议的295万条会议信息(自2009年开始收录),及已被确定接受但还未最终印刷出版的手稿(article-in-press)。覆盖各种疾病、药物和医疗器械信息。
特点:1比Pubmed覆盖的期刊更多(欧洲,亚洲期刊覆盖率多30%);2检索主题词库远大于Pubmed,且更新迅速,检索最新医学文献信息更全面;3检索界面便捷,文摘分类工具多样;4更专业的循证医学类文献检索,PICQ分类检索等;5更专业的医学,药学,医疗器械文献检索模块。
三、文献党下载器(wxdownorg)大型文献检索下载平台。几乎整合了所有中外文献数据库资源,覆盖全部学科,关于医学文献数据库的有:Web of Science、Elsevier(sciencedirect)、PubMed(生物医学)、Emerald(生物医学)、Ovid(医学库)、ClinicalKey、UpToDate、万方医学网、知网、中华医学期刊全文数据库等等,还有世界顶尖期刊《柳叶刀》The Lancet、《新英格兰医学期刊》NEJM、《美国医学会杂志》JAMA、《英国医学期刊》BMJ等等,特点:只要有互联网在哪里都可使用该网站下载文献。
四、ClinicalKey临床精钥是信息分析公司爱思唯尔(Elsevier)推出的一个临床决策支持工具,帮助医生快速获取准确、简洁、世界前沿的循证医学知识。临床精钥包含了经本地专家参与审阅编辑的基于最新证据及实践指南的临床综述,并收录了如Braunwald’s心脏病、罗森急诊医学等经典图书,涵盖超过25000种中国临床用药信息,并有400多种医学评分工具等。ClinicalKey还有一优点提供中文界面,可以用中文关键词检索,系统自动匹配英文,从而检索到自己需要的英文文献。
五、Ovid隶属于威科集团的健康出版事业集团,与LWW、Adis等公司属于姊妹公司。Ovid发展到今天,已经成为全球最受欢迎的医学信息平台。Ovid在医学信息服务领域,无论在技术领先性、数据质量以及用户检索体验等等上,均为排在全球第一。
六、UpToDate临床顾问数据库是用于协助临床医生进行诊疗上的判断、决策的循证医学数据库。UpToDate覆盖了常见的 25 个临床专科,涵盖了诊疗全流程和全生命周期的绝大多数疾病及其相关问题,目前已收录11,000多篇临床专题,全部专题皆由 UpToDate在全球范围内招募的6700多位临床医师,浏览了高质量期刊、文献证据后加上个人专业经验和意见撰写而成。除了核心的临床专题外,UpToDate还提供多平台访问、智能搜索、图表导出生成PPT、重要更新、诊疗实践更新、患者教育、计算器和药物专论等多项功能。
七、Wiley 作为全球最大、最全面的经同行评审的科学、技术、医学和学术研究的在线多学科资源平台之一,“Wiley Online Library”覆盖了生命科学、健康科学、自然科学、社会与人文科学等全面的学科领域。有1600多种经同行评审的学术期刊,20000本电子图书,170多种在线参考工具书,580多种在线参考书,19种生物学、生命科学和生物医学的实验室指南(Current Protocols),17种化学、光谱和循证医学数据库(Cochrane Library)。
八、PubMed 是一个免费的搜寻引擎,提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科。PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文,但可提供指向全文提供者(付费或免费)的链接。
九、Cochrane library(考克兰图书馆)是the Cochrane Collaboration的主要产品,由美国Wiley公司出版发行,汇集了关于医疗保健治疗和干预有效性的研究。它是循证医学的黄金标准,可以帮助参与卫生保健决策人员及时了解最新证据,为他们提供有关现有治疗方法和新治疗方法的高品质信息。主要面向临床医生、决策者、研究人员、教育者和学生等用户。
十、Karger医学电子期刊是由瑞士Karger出版社出版,每年出版约80余种高质量的学术期刊,大部分以英文出版,内容涵盖了整个生物医学领域,包括传统医学以及最新的医学热门课题。Karger电子期刊被Google全文索引,并且被收录在所有著名的二次文献数据库,例如MEDLINE、CAS、Current Contents、Reference Update、让用户可以轻易的在网络上找到Karger出版的医学文献。
十一、BMJ Best Practice(BP)是英国医学杂志(BMJ)出版集团于 2009年2月出版的升级版循证医学数据库资源,它在BMJ Clinical Evidence(临床证据)中的治疗研究证据的基础上,增添了由全球知名学者和临床专家执笔撰写的,涉及个体疾病的诊断、预防、药物处方、国际临床指南和随访等重要内容。此外,BP中还提供了大量的病症彩色图像和数据表格等资料,有效解决了医生在临床工作流程的各个环节需要的关键信息和知识。
十二、世界医学顶尖期刊:《柳叶刀》The Lancet、《新英格兰医学期刊》NEJM、《美国医学会杂志》JAMA、《英国医学期刊》BMJ
一般看质谱图最好先扣除本底,44可能是CO2。如果基线的质谱图里也有很强的44的话,你在匹配NIST之前应该先做扣除一下本底,以消除本底噪音和相邻化合物的干扰。你的两张图都有这个问题,都取的单点而且没有扣除本底。相比标准图谱来说,这个应该是苯
蛋白质结构数据库(Protein Data Bank,简称PDB)是美国纽约Brookhaven国家实验室于1971年创建的。为适应结构基因组和生物信息学研究的需要,1998年10月由美国国家科学基金委员会、能源部和卫生研究院资助,成立了结构生物学合作研究协会(Research Collaboratory for Structural Bioinformat-ics,简称RCSB)。PDB数据库改由RCSB管理,目前主要成员为拉特格斯大学(Rutgers University)、圣地亚哥超级计算中心(San Diego Supercomputer Cen-ter,简称SDSC)和国家标准化研究所(National Insti-tutes of Standards andTechnology,简称NIST)。和核酸序列数据库一样,可以通过网络直接向PDB数据库提交数据。
Mw
分子量
Formula
分子式
Qu
概率: 将未知光谱正确识别为参比光谱的概率。大于 90 的值即表示获得了较完美的匹配。其值小于 50 意味着未知光谱与参比光谱之间存在较大差异,对此匹配需要进一步确认。+/-5 范围内的概率差异通常属于可接受范围。概率值前面的星号 () 表示匹配中使用了分子离子。如果没有星号,则表明未使用分子离子。
此概率值包含了所有其他统计因素。它属于实验测定值;即,该值是使用 K、dK 和其他值通过“查表”获得的概率值。此查寻表由 McLafferty 及其合作者共同制作完成,在实验过程中使用了大型数据库进行检索,并对检索结果进行了充分的评估。
最终获得的概率值是经干扰修正的 IV 类可靠性值。IV 类可靠性概率值表示匹配可能为精确匹配,即匹配项为同源系列成员或异构体。因此,不应假定匹配列表中的第一个匹配项一定是正确的识别项。
CAS 号
NIST 和 Wiley 质谱库中的许多化合物都是通过其 CAS (化学文摘服务)编号进行识别的。打印此编号可以提供比化合物名称更明确的标识方式。在用户创建的数据库中,此编号是标题信息的 CAS 字段中的编号。
参比光谱数量 (Ref#)
谱库中的条目数。
K
K - 置信因子。该值的范围通常为 15 至 250,与未知光谱与参比光谱的相似性有关。通常,值越高则表示未知光谱与已知光谱的相似性越高。
dK
dK - “完美匹配”(将参比光谱与其自身匹配而得)与未知光谱置信因子的差值。dK 值为 0 则表示未知光谱与已知光谱之间完美匹配。通常,较低的 dK 值表示“良好的匹配”,即,未知光谱与参比光谱之间的差异很小。在多数情况下,低 dK 值比高 K 值更具判断价值。
F1:标记
压缩参比光谱中存在但未知光谱中不存在的离子的数量。0 值表示匹配非常好,但 3 也未必表示较差的匹配。
%
PBM 计算的光谱的纯度测量值。PBM 设计用于寻找混合物的成分。因此,处理中先假定低纯度(小比例因子),然后依次尝试使用较高的比例因子,直至找到参比光谱与未知光谱的完美匹配。100% 表示进行最佳比较时没有对参比质谱进行缩放。
杂质 (Con)
杂质因子 - 纯度的另一个测量值。该值范围为 0 至 100,0 值是最希望出现的值。通常,% 和 Con 因子的值成反比,也就是说,如果 % 值较高,则 Con 值会较低。
C_1
I 类杂质修正可靠性值。100 表示精确匹配。但通常来说,质谱仪无法区别异构体或同源系列成员,因此该值总是小于 100。
倾斜 (Tilt)
如果在检索策略中启动了“倾斜”并使用倾斜的光谱来确定最终的匹配概率,则“倾斜”列中显示的数字表示与非倾斜光谱相比,在 IV 类 (R_IV)可靠性方面的提高。另请参阅倾斜。
R_IV
IV 类可靠性值。匹配可能是精确匹配、异构体或同源系列成员,也就是说,该值代表质谱仪的诊断能力。其值范围为 0 至 99,值越高表明匹配越好。
XCorr
交叉相关系数。在此选项打开时,该值用于对检索结果进行排序。前向检索算法为每个匹配项生成相关系数。前向检索算法要求参比光谱中必须包含未知光谱中的全部重要离子。
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