k-ras的突变癌症

k-ras的突变癌症,第1张

研究表明约30%的人类恶性肿瘤与RAS基因突变有关,ras突变后的产物可以一直处于活化状态。在白血病,肺癌,直肠癌和胰腺癌中,k-ras突变均很常见,其中直肠癌中30%-35%患者有突变。其与肿瘤细胞的生存,增值,迁移,扩散,血管生成均有关系。k-ras基因分为突变型和野生型,常见突变位点为K-RAS基因2号外显子的12号密码子和13号密码子上,3号外显子的61号密码子,其中有7个突变热点:G12C、G12R、G12S、G12V、G12D、G12A、G13V/D这7种突变占到了90%以上。

在我们惋惜的时候,不得不正视一个问题

癌症,正越来越年轻化!

早在10年前就有研究发现,青年患癌并不罕见,且发病有增高趋势,每年被癌症夺取生命的年轻人不在少数。

这五大习惯,导致越来越多的年轻人患癌,你还不改吗?

习惯一:熬夜是家常便饭

长期熬夜会扰乱人体生物钟,导致肿瘤抑制基因受损,神经内分泌系统功能失调,免疫力下降,容易发生癌性肿块。

习惯二:一做一整天,不运动

长期久坐的人肠道蠕动减弱变慢,腹腔、盆腔、腰骶部血液循环不畅,肠道免疫屏障功能下架,身体代谢也易出现问题,患结肠癌的风险增大。

习惯三:过劳

人体常年处于过度劳累和精神紧张的状态,免疫机能就会被消减,身体修补DNA的能力下降,淋巴瘤最容易被累出来。

习惯四:饮食无辣不欢、越冰越爽

长期喜欢喝冷饮,越冰越爽,还无辣不欢,这些都很伤脾胃,饥一顿饱一顿,饮食不规律,也会影响正常的肠胃功能。

火锅、烧烤、麻辣烫等,损伤胃粘膜,破坏胃肠道的正常活动,增加胃癌的得病几率,他们还可能会烫伤口腔、食道黏膜,引起慢性炎症反应,增加食道癌变的风险。

胃粘膜的上皮细胞约2-3天会更新一次,再次修复的过程是在夜间胃肠休息时候进行的,如果经常吃宵夜,则会影响粘膜修复,容易引发胃癌。

习惯五:仗着年轻,不把病当回事

很多年轻人觉得,小病没事,不去医院,错过了疾病最开始的信号,也错过了最佳的治疗时期,等到发现为时已晚。

最易忽视的癌症信号:血、块、痛、烧、减

不要放过明显的癌变信号。早发现、早诊断、早治疗对癌症患者至关重要。

为此,专家特将癌症早期报警信号总结成容易记忆的“癌症信号五字诀”,即:血、块、痛、烧、减。

1、血(出血): 出现不明原因出血,虽不一定是癌症,但至少证明身体出现问题了。当然这里指的不是正常月经和擦伤等。

2、块(异常肿块)

(1)身体浅表部位的肿块多为淋巴结,但如果久久不消退,还有迅速增大的趋势,有时还会出现溃烂、瘙痒的症状,这就有可能是癌肿。

(2)乳房肿块非常常见,大多数是良性的结节,但如果它具有不规则、边界不明、乳头溢液,乳房皮肤变成橘皮样,多半跟乳腺癌有关。

3、痛(疼痛)

(1)头痛持续加重,还伴有呕吐、恶心、视物不清等症状,或许是脑瘤的表现,也可能是其他肿瘤脑转移所致。

(2)颈部出现疼痛和紧迫感,面部出现水肿,这些都可能是肿瘤压迫上腔静脉所所致。

(3)胸骨突然出现疼痛、烧灼感,吃东西吞咽不顺,可能跟食管癌、胃癌有关。

4、烧(发烧)

专家表示,正常的发烧一般不会持续太久,而且多为高烧。如果持续低烧,儿童要警惕血液系统肿瘤;成人持续低烧,要警惕肝癌和肾癌。

5、减(体重减轻)

不节食,没有加强运动,但短期内体重明显减轻,并且持续下降,可能跟肿瘤有关。

送你防癌“三字经”

一:常喝茶

国内外一些研究证明,无论哪种茶叶,对实验动物的化学致癌或转移性肿瘤,都有不同程度的防治效果。所以,日常 养生 喝茶的习惯很有必要。

绿茶是一种未发酵过的茶,保留了比较多的天然成份,研究显示绿茶能降低乳腺、前列腺、肺部、口腔、膀胱、结肠、胃、胰腺等多种肿瘤发生的危险性。绿茶防癌在已知的各类能抗癌的食物中名列前茅。

蒲公英根茶泡水,有助于预防胃癌,蒲公英在抗感染方面,有着良好的作用,被中药界誉为具有清热解毒,抗感染作用的 "八大金刚"之一,在一定程度上可代替抗菌素,有广谱抗菌素的作用。对金**葡萄球菌、胃幽门螺杆菌等有很强的杀菌作用,对于预防胃癌有很好的效果。

玉兰根茶泡水,有助于预防结肠癌,玉兰根含有苦苣多糖,可改善肠道环境,对防治结肠癌有益,日常泡水喝,对结肠炎有很好的效果。

鳄嘴花茶所含有的三萜类、碳苷黄酮类、叶绿素类等物质都是有抗肿瘤作用的物质,具有较广泛的抗肿瘤作用。对白血病、黑色素瘤、卵巢肿瘤、淋巴癌、肝癌、肺癌、胃癌、乳腺癌、宫颈癌、结肠癌、前列腺癌、膀胱癌、鼻咽癌的癌细胞都有一定的抑制作用,表现出较强的抗肿瘤活性。

二:戒烟酒

抽烟的人有一半会死于与抽烟相关的疾病,其中很多是癌症。在美国,90%的肺癌是直接由抽烟引起的,另外有3%是因为吸入二手烟造成的。

每天吸一包烟的“吸烟者”每年每个肺细胞(lung cell)中会累积平均150个额外突变;膀胱中每年每个细胞平均产生18个突变,肝脏中每年每个细胞平均产生6个突变,大大增加了抽烟者的患癌风险。

喝酒过多,有毒物质超过肝脏负荷,就得持续“加班”来解毒,久而久之,肝脏排毒能力就会下降,如果再持续喝酒,肝脏损害更加严重,久之就会诱发肝炎和肝硬化、肝癌。

所以,建议大家平时戒烟酒。

三:多运动

中度运动是科学家推荐的运动方式。

据研究,每天散步一小时可以把患结肠癌的可能性降低46%。

美国癌症协会建议人们每天至少做60分钟中度或稍强烈的运动,每周运动五次以上。

过度肥胖也会增加患癌症的可能,而运动有助于预防肥胖。

四:少熬夜

研究资料显示,癌细胞是在正常细胞分裂过程中发生突变而形成的。

夜间是细胞分裂最旺盛的时期,如果夜晚睡眠不足,人体的免疫力降低,发生变异的细胞不容易被及时清除,从而可能导致癌症的发生。

而熬夜者为提神常吸烟喝咖啡,也易使更多的致癌物进入人体。

五:少生气

90%以上的癌症均与精神、情绪、心情有直接或间接的关系。

人体免疫系统受神经和内分泌的双重调控,生气抑郁恐惧等不良情绪作用于中枢精神系统,引起植物神经功能和内分泌功能失调,使机体免疫功能受到抑制,而机体内平衡被打破使细胞失去正常状态和功能,就会不断变异产生癌细胞。

同时,不良情绪还会减少人体内抗体的产生,阻碍淋巴细胞对癌细胞的识别和消灭,使癌细胞突破人体免疫系统的防御无阻止地生长,形成癌肿。

长期生气导致的内分泌功能紊乱和人体的免疫功能低下,使得癌症更容易发生。

人体的细胞每天都新陈代谢,新生细胞的生成过程如同一个产品生产的流水线,正常情况下,如果偶尔生产一个残次品,就会被“质量监督员”发现并处理掉。但是,假如残次品产生太多,“质量监督员”来不及处理,残次品最终就制造出来。假如残次品还在源源不断的产生,越积累越多,问题就出来了。

以上过程,就类似于癌症的发生过程,癌细胞就是这些残次品。

一、癌细胞怎么产生的呢?

慢性炎症刺激,或者持续的致癌物(包括放射物、黄曲霉、亚硝酸盐、病毒、PM25等)可以诱发正常细胞癌变。偶尔发生的炎症,或者偶尔的致癌物刺激,少量突变的细胞很快被清除掉,但持续的、长期的刺激,突变的细胞越来越多,就会导致癌症的发生。

比如,HPV(人乳头状病毒)持续感染导致宫颈癌;乙肝病毒慢性感染,或者长期食入被黄曲霉毒素污染的食物会导致肝癌;久治不愈的胃溃疡易恶变成胃癌;空气污染及长期抽烟诱发肺癌;长期便秘诱发直肠癌;低劣建材过度装修诱发白血病等。

二、为什么患癌的年轻人越来越多?

癌症的发生,不是一朝一夕的事情,而是与上述致癌物的刺激时间和刺激量有直接关系。一般情况下,从青少年开始受到各种致癌物的刺激,等到中年就形成了癌症。假如致癌物太多,刺激太强烈,很可能就提前发病。

不良的生活习惯,以及严重的环境污染,加速了癌症的发生。所以说,癌症低龄化的根本原因是严重的环境污染及不 健康 的生活方式,如果不尽早改变,问题还会越来越严重。

这个趋势确实存在着,对过去20年北美癌症患者数据库的一项最新分析表明,50岁以下癌症患者明显增多。

根据英国儿童癌症基金会的研究报告,过去16年间,儿童患癌率增加了40%。

这一趋势中少部分是因为诊断技术的改善的原因,而大部分是因为环境因素造成的。

例如结肠癌患者年轻化在某种程度上是因为很多有家族史等危险因素的年轻人做肠镜而获得早期诊断,还有一些癌症通过基因诊断能够被早期发现。

大部分年轻癌症患者是因为以下两个原因造成的。

一是肥胖,成年人超重和肥胖率持续升高,经过将近20年的时间,终于在癌症发病率上体现出来。如果不努力控制体重和减肥,患癌的风险就会升高,患癌的时间也会提前,所以要终身控制体重,不能松懈。

二是空气污染,空气质量下降是全球化趋势,在中国尤其严重,人们长年累月呼吸污染的空气, 健康 会收到持续损害,癌症就是其中之一。因此要力所能及地做好预防空气污染的措施,不要习以为常地麻木。

并非所有的癌症都能预防,但采取相应的措施,可以有效地降低患癌风险。

为什么现在越来越多年轻人会得癌症?

癌症是典型的的慢性病,老年病,但这些年临床和统计结果,发病率逐年上升,并呈现年轻化的特点。原因大致有以下几个方面,一是环境污染,空气质量,水的质量不好;二是生活习惯不好,很多人玩 游戏 ,经常熬夜,人体生物钟紊乱;三是饮食习惯不好,饮食结构不合理,暴饮暴食,喝酒吸烟;四是 社会 压力大,升学,就业,买房,就医,上学的压力都是空前的;五是活动量太小,有的人吃饱了就 游戏 ,根本不出屋;六是现在家庭装修比较豪华,有放射性的材质;七是现在的种植养殖方式发生变化,农药化肥,激素大量使用,早摘,早熟的农作物太多,煎炒烹炸的太多,精加工的太多,造成食物中的营养被严重破坏。

这些原因,导致了各种慢性病的大爆发,癌症只是一少部分,改变人们的 健康 观念,让大众了解 养生 知识,克制自己,管住自己,让大家尽量不得病,得小病,晚得病。

人们的生活水平不断提高了,吃得好了,喝的好了,随便出去吃饭都可以火锅、烧烤。生活变得更加享受,可是人们的身体 健康 状况却大不如前,我们经常听说身边有人患上癌症,在这个谈癌色变的年代,谁都不想提及这个话题,因为即使在这个医学水平发达的今天,癌症仍然是无法攻克的医学难题。癌症也越来越趋于年轻化,这让我们不得不开始防患于未然。

根据年龄,年轻患者的癌症发病率总体呈433/100000。在年轻人中,癌症的发病率301/100000,和年轻的女性57/100000。那么为什么越来越多年轻人会得癌症了呢?

一、环境因素导致

工业化的快速发展使得人们的现代生活条件越来越好,但是我们也会发现生活的环境越来越差,可能我们并没有觉得植物变少,但是当你抬头看看天空,再看看空气你就会发现,空气的质量越来越差了。而环境污染直接给人们带来的就是对身体 健康 的伤害,呼吸的空气质量差,喝的水不干净等,都给人们的身体带来伤害,大大增加患癌的风险。

二、生活习惯导致

1熬夜。 对于现在年轻人来说,熬夜已经成了家常便饭,长期熬夜会扰乱人体生物钟,导致肿瘤抑制基因受损,神经内分泌系统功能失调,免疫力下降。还会引起心脑血管疾病,还是增加癌症的发病率,已经有研究证实,长期上夜班,会增加乳腺癌发病率。

2抽烟。 抽烟是会导致肺癌的,我们现在经常会看到不管男女,甚至于现在很多初中生已经开始接触烟草,现代人生活压力大,很多人通过吸烟来排解压力,但是这是伤害身体的行为。

3喝酒。 饮酒的危害性也是非常大的,即使少量喝酒,也是对身体有害的。饮酒可增加肝癌,结直肠癌,乳腺癌,食管癌等癌症的发病率。

三、饮食习惯导致

俗话说病从口入,这句话是有一定道理的。现在年轻人的饮食习惯是无辣不欢,无冰不爽。

全球有一半的胃癌和食管癌发生在中国。我们吃饭喜欢重口味,放盐多,又喜欢吃腌制食品。咸鱼,腌肉等腌制食物,已经被列为致癌物,这些食物含有较多的盐分,而且腌制的过程中会产生亚硝酸盐等致癌物质,长期大量的食用,会增加食管癌,胃癌,大肠癌等癌症的发病率。

四、不重视、没意识所导致

很多年轻人,觉得自己身强力壮,怎么可能患病呢?所以,一般患了一些小病不重视,不当回事,久而久之可能会拖成大病,错过了最佳治疗时机,所以,即使年轻,也不是没有患癌的风险,当身体有一些不适症状时,最好就医检查,及时治疗,避免严重后果的发生。

主要是因为压力大,年轻人背负房贷的占比越来越高。其次是环境污染,包括空气,食品,饮用水等等。还有不注重好的饮食习惯,饮食不规律。更重要的是智能手机普及后,熬夜的太多,睡眠不足导致免疫力下降

大环境就不要去吐槽了,什么水质,空气,食物,环境等等。这些外部原因我们个人很难去改变。就像你生活在四五十年前很可能会被饿死,六七十年前很可能在战场被打死一样,每个年代都有不同的外部环境导致你挂掉。现在年轻人得绝症,作为我们自己所能做的是加强 体育 锻炼,饮食上注意,不吃烧烤之类的垃圾食品,平时多注意下身体,特别是年轻人,不要以为年轻就可以通宵,可以透支身体。命由天定,我们做的只有是尽人事。我不想回答为什么现在得绝症的人多了,因为这个问题不能去被证明,或者简单的说,可能总人口多了,在比例不变的情况下,得绝症的人肯定多了。问问题的应该比较悲观。心态是非常非常重要的。消极悲观的心态会毁了你的 健康

首先非常感谢你的邀请,虽然现在 科技 医疗水平越来越发达了,但是现在疾病也越来越复杂化,有些疾病越来越年轻化,低龄化,例如:艾滋病,癌症(癌症种类繁多)心脑血管疾病等;有人会问为什么这些疾病越来越年轻化了,主要诱因太多,熬夜,喝酒,抽烟、不经常运动,饮食习惯不规律,经常应酬饭局,也包括每个人身体体质不同,总而言之还是那句话,身体是自己,生命是父母给予的!养成良好生活习惯,疾病自然远离!希望大家都健 健康 康的!

民间中医有说:不通则病,通则不病。其实,癌症大多是人体内有肿瘤而遇到各种化学毒素侵入后就排毒不畅累积化学毒素化学反应破坏人体 健康 基因发作癌症!治疗癌症,首先要实事求是研究出癌症发病的真正原因才好对症下药!既然癌症是由于身体肿瘤有关,我们是否可以设法化解肿瘤后再及时排毒出去不伤身体去开刀好(但是,这个不伤身体的化解肿瘤的过程是很痛苦很挣扎的,一般人是做不到的,不是自己不能坚持就是被那些庸医给半路拦截了)?一位美容院老板娘朋友,前些年高烧后肺部积水,三四家医院检查都说是癌症!她不甘心,最后去肺结核医院再查,一位老医生带着学生帮她检查时说:肺部有痰!她听后就放心了。结果医院帮她把那痰吸出来后,肺部积水自然退去,身体不久康复如初,如今她坚强不息把美容院越搞越大,身体比一般人强很多,这个励志故事值得我们学习!

如何在数据库里面找到疾病相关的microrna表达情况:好像还没有这样的数据库。癌症比较复杂,microRNA在癌症中的表达谱差别比较大,各阶段、各类型、甚至个体之间也有差别,结论也不完全统一。可以查一下最近microRNA相关的综述,可能会有比较全的介绍

1、遗传

真真正正立即遗传的恶性肿瘤十分少见,往往癌症和遗传因素相关,是由于遗传提升了人体恶性肿瘤的共性和对致癌因子的敏感度,也就是临床医学常说的“遗传易感基因”。用简单得话而言便是“得癌身体素质”,包含了性染色体、遗传基因不稳定等层面。并且,一部分癌症还显出了大家族集聚趋向,例如早期肝癌、肺癌、直肠癌等,这除开和遗传基因因素相关外,后天性一同的生活自然环境、饮食结构也是发病凶犯。

2、免疫力因素

此外,先天性或后天性的免疫缺陷也是引起恶性肿瘤的一大因素,例如丙种蛋清注意力不集中症状病人,中后期患淋巴结和造血功能系统软件恶性肿瘤概率较高。而长期患HIV的人,中后期恶性肿瘤发病率也会持续上升。但是特别注意的是,绝大多数恶性肿瘤都产生在了免疫力功能“一切正常”的群体中,这关键取决于恶性肿瘤能逃离人体免疫系统的监管,且毁坏人体人体免疫系统,但这类体制临床医学上都还没彻底确立。

3、欠佳的生活习惯性

生活因素是后天性致癌物质的一大缘故,这包含了生活中好几个坏习惯,例如长期性抽烟喝酒、生活作息不规律等。临床医学上面有接近三分之一的因癌症而身亡的人,都和抽烟有关系,吸烟是导致肺癌发生的关键风险因素。

而长期性摄取很多乙醇会立即刺激性消化系统,提升牙科、喉咙及其食道恶性肿瘤的发病率。与此同时,乙醇在肝部内新陈代谢的历程中,还会继续造成正中间类化合物乙醛,这不仅仅会导致酒精肝发生,中后期还可成长为肝硬化腹水、早期肝癌等重疾。

而经常熬夜看起来是没什么危害,可是却会弄乱中枢神经系统,导致身体内内分泌失调。女士长期性内分泌失调,也是一些恶性肿瘤的突破点,这包含了乳癌、卵巢疾病等。

4、饮食搭配

当代人的膳食多元化,但绝大多数特色美食都逃不出高盐份、高热量食物的基本定律,例如年青人钟爱的油腻、烤串、腌渍食材等,看起来只是很有可能会造成三高病症发生,但其和癌症中间也是有一定联络。油腻或烧烤食物通过高温加温,不但营养元素被毁坏,与此同时也会造成亚硝胺、苯系物及其正丁酸等多种多样致癌物。

而腌渍食材、生产加工肉类食品中又带有很多硝酸盐,虽然硝酸盐对身体没害,但在胃液功效下,硝酸盐便会转换为致癌物质亚硝酸。除此之外,常常吃滚热、含有刺激性的食物也可导致不断的消化系统粘膜损害,提升病变很有可能。

癌症发生是综合型因素刺激性的结果,就算是有大家族遗传特点,也可根据后天性饮食搭配、生活调节、按时常规体检等方法防止和发觉初期病变。针对没有家族史的朋友们而言,避开致癌物质因素也是大幅度降低了中后期得癌的概率。

SWI/SNF复合体 是四大类染色质调控因子家族中的重要一类。SWI/SNF复合体又可细分为三个成员,称为cBAF,pBAF以及ncBAF。这些复合体都是由10-15个亚基组成,而且大部分亚基都有多个同源蛋白。在不同的组织中或不同的发育阶段,这些亚基排列组合,产生多种不尽相同的SWI/SNF复合体,参与不同的基因调控。SWI/SNF复合体就像“乐高积木”拼成的扳手,利用ATP的水解,调控DNA在组蛋白上的滑动或使DNA脱离组蛋白,最终或者使DNA变得致密而阻碍转录,或者使DNA变得松散而促进转录。不同组织不同基因位点的染色质重塑结果会有不同,这些重塑决定了基因表达的特异性 1,2

在过去的十年时间里,对SWI/SNF的研究越来越多。这是因为SWI/SNF的亚基突变在几乎所有癌症中都有观察到,而且它们的突变非常多,其频率可以和PI3K,PTEN,P53这些经典的癌症相关基因的突变频率相比肩 3 。cBAF是SWI/SNF中丰度最高的复合体,ARID1A和ARID1B是cBAF中互为同源的最大的亚基,其长度大于2000个氨基酸。ARID1A基因的突变频率是SWI/SNF所有亚基中最高的。 在一些癌症类型中,ARID1A的突变频率可高达50-60%。

在寻找应对携带ARID1A突变的癌症的策略时,人们多利用了“合成致死”效应。这种效应的原理是,在一个基因失去活性的基础上(绝大部分突变使ARID1A失去功能),如果合并了另外一个基因的失活,则细胞致死。虽然多个ARID1A的合成致死基因已经被报道,但大部分没有进一步跟随研究,多为孤立报道,因此离临床实践还比较远。最先报道和最被认可的ARID1A合成致死基因是ARID1B,即ARID1A的同源基因 4 。ARID1A或ARID1B通常以互斥的方式存在于同一细胞中的cBAF复合体中。细胞水平的研究发现,ARID1A突变细胞系如果敲除或敲低了ARID1B,会使细胞生长受到很大抑制。这一现象虽然非常吸引人,但在动物水平是否也是如此并不清楚。而且一些癌症样本同时携带了ARID1A和ARID1B两个突变,使得这种治疗策略变得更加有风险。

除了合成致死效应,对于SWI/SNF的基础的生物学了解还很缺乏。首先,SWI/SNF的失活是如何促进或抑制癌症发生的并不清楚。其次,SWI/SNF因为部分亚基的突变或缺失而失活后,复合体在分子水平上发生了什么样的变化并不清楚。第三,发生变化后的SWI/SNF仅仅失去了原有活性还是获得了不应该存在的异常活性并不清楚。这些未知一方面归因于对复合体发生变化后的分子水平的描述还不完整,另一方面归因于这些变化和相关的细胞或动物表型联系的缺失。

2020年9月7日,德州大学西南医学中心的 Hao Zhu 团队(第一作者为 王子曦 博士)在 Nature Cancer 上发表了文章 Dual ARID1A/ARID1B loss leads to rapid carcinogenesis and disruptive redistribution of BAF complexes 从动物模型到分子水平系统探索了ARID1A和ARID1B同时缺失的影响。

文章重点关注了肝脏的表型,做了肝脏中ARID1A和ARID1B双缺失的小鼠模型,因为全身缺失ARID1A或ARID1B任意一个基因都是致死的。 肝脏中,缺失ARID1A或ARID1B在动物正常生长过程中都和野生型几乎相同 (在年老的动物中,ARID1A的缺失可能会增加肝脏形成肿瘤的概率和肝脏的大小)。肝脏双敲除ARID1A和1B的小鼠有约三分之一在断奶前死亡,说明的这两个基因对发育的重要性。但存活下来的小鼠能够正常的活到成年。双敲除小鼠在一个半月的时候就能观察到肝脏明显增大并伴有囊肿,到10个月的时候肝脏遍布肿瘤,有些小鼠还存在肺和脾的转移瘤。这些双敲除小鼠随着肿瘤恶化和肝脏功能丧失,多在一年内死亡。这一观察说明双敲除在动物中更有可能导致癌症而不是合成致死。mRNA-seq和qPCR证实,双敲除的肝细胞发生了去分化过程,参与肝脏代谢的酶类表达下调,表现为AST,ALT等肝功指标异常以及黄疸。而细胞周期相关基因表达则大大增加。

为了进一步证实双敲除的致癌效应,研究人员利用了全身条件性敲除的小鼠模型(UBC-CreER)。在低剂量tamoxifen诱导下,成年小鼠全身组织内发生了部分细胞的ARID1A和1B敲除。在短短2-3个月的时间里,小鼠的耳部,口鼻部,四肢等毛发较少的皮肤区域产生了恶性的鳞状细胞癌。另外,在ARID1A和1B天然双缺失的癌细胞系中重新表达任意ARID1A或1B蛋白都将导致细胞生长完全停滞。这些证据进一步表明在一些细胞中,双敲除具有促癌而不是抑癌效应。

接着,研究人员从分子层面探索了SWI/SNF在ARID1A和ARID1B缺失后的变化。因为ARID1A和1B只存在于SWI/SNF家族中的cBAF复合体中,研究人员首先分析了cBAF的变化。缺失了ARID1A和1B后,cBAF解离成了数个不同的亚复合体,主要包括以下三种形式:1 只是缺失了ARID1A和1B,而其它亚基相对保持完整的亚复合体;2 包括BAF170/155/60/57/47亚基在内的亚复合体;3 包括Brg1/BAF53在内的亚复合体。其中,第一种亚复合体相对完整,最有可能保留了原始功能或者获得了异常活性。对第一种亚复合体的ChIP-seq发现,缺失了ARID1A和1B后,cBAF的功能是失活且没有获得异常活性。

有意思的一个观察是,在ARID1A和1B缺失后,pBAF的寡聚状态发生了变化。虽然Arid1A和1B不属于pBAF的组成部分,但pBAF可能受到了影响。在ARID1存在或缺失的情况下,对pBAF质谱分析提示,因ARID1缺失而解离的cBAF很可能非特异性的粘附在pBAF上,导致pBAF寡聚状态的改变。ARID1的缺失很可能使cBAF中其它蛋白的疏水面暴露,而cBAF和pBAF又共享很多相同的亚基,在结构上具有很大的相似性,这导致暴露的疏水面倾向于结合pBAF。ChIP-seq发现,寡聚状态改变后的pBAF对目标DNA的靶向能力大大减弱。基于之前报道的pBAF的抑癌功能,因ARID1缺失而导致的pBAF功能损害很可能也参与了癌症的发展。

最后,研究人员系统探索了ARID1A和1B蛋白参与cBAF组装的结构域,以及这些结构域中的癌症突变对蛋白功能的影响。ARID1蛋白通过C端两个保守区域来组装cBAF复合体。而C端第二个保守区域内,围绕LxxLL基序产生的错义突变更可能使蛋白失活。基于C端序列的保守性,几乎所有无义突变都会使蛋白失活。

总之,这篇文章探索了ARID1A突变的癌症的治疗策略,为区分驱动突变 (driver mutations) 和乘客突变 (passenger mutations) 提供了理论基础。

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