uniprot蛋白质序列数据库由哪几部分组成？各有什么特点

将PIR、SWISS-PROT和TrEMBL3个蛋白质数据库统一-起来组建而成，包含3个部分:

(1) UniProt Knowledgebase (UniProtKB) ，这是蛋白质序列、功能、分类、交叉引用等蛋白质知识库，记录经过人工筛选和注释

■ (2) UniRef ( UniProt Non-redundant Reference )

数据库，将密切相关的蛋白质序列组合到一条记录中，以便提高搜索速度目前，根据序列相似程度形成3个子库，即UniRef100、UniRef90和UniRef50

■ (3) UniParc (UniProt Archive)，是UniProt存档库 ,

收录所有蛋白质序列。用户可以通过文本查询数据库，可以利用BLAST程序搜索数据库，也可以直接通过FTP下载数据。

1 .首先打开官网，在搜索框前面的选择框中选择“gene”，在后面的搜索框中键入“CD47”，点击search

2 .可以在d出的新页面中查看搜索结果。 你可以在这里看到各种相关基因的链接。 这里选择单击CD47molecule[HomoSapiens(Human ) ]

3 .在d出的网页上可以看到这种蛋白质的概要

4 .往下拉，可以看到基因信息、染色体上的位置、表达分布、相互作用、蛋白质和mRNA的序列等其他信息。 这里隐藏了所有的信息，只显示标签，有兴趣的人可以自己点击查看。 另外，里面的信息可以看引用文献。

这是基因信息和染色体上的位置

表现分布。 上面的复选框是数据源

PubMed中的文献及蛋白质功能相关文献

mRNA和蛋白质序列

5 .接下来我们来看看mRNA序列。 可以看到序列号、长度、相关文献等。

为了能看到mRNA上每个区域的划分、外显子、编码区域、氨基酸序列等，会持续下降。

7 .点击前面的“CDS”，最后的序列中就会看到编码靶蛋白质的核酸序列。 点击fasta可以下载序列。

uniprot这个名字是通用蛋白质的英文缩写，介绍信息丰富的蛋白质数据库。

1 .同样搜索“CD47”这种蛋白质吧。

2 .下面是这一页跳出的结果。

中间的表包括蛋白质的标签、蛋白质和基因名称、是否人工注释(黄色标签)、属种等。

3 .在这里，选择第3个“CD47_HUMAN”。 紧挨着跳跃的网页有蛋白质名基因名和属种。

页面的左侧是整个网页的目录，其中包含有关该蛋白质的所有信息，包括功能、细胞定位、PTM、交互、高级结构、序列和其他数据库的链接。

这是蛋白质细胞定位和序列的域

这是蛋白质的结构信息，点击后面的链接，可以在RCSB数据库中查看详细信息。

以下为序列信息，包含4个可变拼接体。

以下是关于该蛋白质的其他数据库的信息

以上就是今天的分享。 周边很多人主要没听说过蛋白的信息，或者没想到找的时候会去看蛋白的信息。 如果在阅读文献之前能够搜索这些数据库，大致了解蛋白质的信息，在阅读文献时就会在心中计数。

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