肝肾同源理论源于《内经》。 “肝肾同源”是指肝肾的结构和功能虽有差异，但其起源相同，生理病理密切相关，可采用“肾肝同治” 的治疗法则。在先天，肝肾共同起源于生殖之精；在后天，肝肾共同受肾所藏的先后天综合之精的充养。
“人始生，先成精，精成而脑髓生”（《灵枢。经脉》），“肾生骨髓，髓生肝”（《素问。阴阳应象大论》）。 故“肝肾同源”又即肝肾的结构和功能体系通过某些中心环节而密切相关。“肝肾同源于精血”意即肝肾的结构和功能体系通过“精血”这一中心环节而密切相关。
《素问·五运行大论》云：“北方生寒，寒生水，水生咸，咸生肾，肾生骨髓，髓生肝”，揭示了肝肾两脏之间相互联系、相互影响的密切关系，体现了祖国医学的整体观念。“肝肾同源”的哲学思想渊源于《易经》，医学基础根源于《内经》，临床实践丰富于汉唐金元，理论体系形成于明代，实验研究发展于现代。
《素问·阴阳应象大论》曰：“肾生骨髓，髓生肝。”吴昆注曰：“髓生肝，即肾生肝，水生木也。”可见《内经》认为，“肾”是通过“髓”生养“肝”而体现“母子”联系的。“脑为髓海”，“肾生肝”的生理功能，必然受到“脑髓”的调控。不但“肝肾”生理联系如此，而且病理影响亦然。
肝与肾之间的'关系
主要表现在精血同源、藏泄互用以及阴阳互滋互制等三个方面。
1.在精血同源方面
(1)生理上
肾精和肝血之间存在着相互资生和相互转化的关系，而且精和血皆由水谷之精化生和充养，故称之为“精血同源互化”。
(2)病理上
肝血不足与肾精亏损多可相互影响，形成肝肾精血两亏的病变。
2.在藏泄互用方面
(1)生理上
肝气疏泄与肾气封藏，相反而相成，从而调节女子的月经来潮、排卵和男子的排精功能。
(2)病理上
肝肾藏泄失调，女子可见月经周期失常，经量过多或闭经，以及排卵障碍，男子可见阳萎、遗精、滑泄或阳强不泄等症状。
3.在阴阳互滋互制方面
(1)生理上
肾阴滋养肝阴，共同制约肝阳，则肝阳不偏亢肾阳资助肝阳，共同温煦肝脉，可防止肝脉寒滞。
(2)病理上
形成肝肾阴虚，肝阳上亢以及肝肾阳虚，肝脉寒滞之证。
正因为肝和肾之间存在着精血同源、藏泄互用，以及阴阳互滋互制等密切关系，所以有“肝肾同源”或“乙癸同源”的说法。
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