(1)大部分酶：酶是活细胞产生的一类具有生物催化作用的有机物，除少数的酶是RNA外，绝大多数的酶是蛋白质。
(2)部分激素：如胰岛素、生长激素，其成分为蛋白质。
(3)载体：位于细胞膜上，在物质运输过程中起作用，其成分为蛋白质。
(4)抗体：指机体受抗原刺激后产生的，并且能与该抗原发生特异性结合的具有免疫功能的球蛋白。
(5)部分抗原：引起机体产生抗体的物质叫抗原，某些抗原成分是蛋白质，如红细胞携带的凝集原，决定病毒抗原特异性的衣壳，其成分都是蛋白质。
(6)受体：神经递质的受体是突触后膜上存在的一些特殊蛋白质，能与一定的递质发生特异性的结合，从而改变突触后膜对离子的通透性，激起突触后膜神经元产生神经冲动或发生抑制。动物激素的受体位于细胞膜或细胞质，与激素发生特异性结合后，将信息传入细胞，引起细胞内发生一系列相应的连锁变化，最后表达出激素的生理效应。
(7)朊病毒：其成分为蛋白质，可导致疯牛病等。
(8)糖被：位于细胞膜的外表面，由蛋白质和多糖组成，有保护、润滑、识别等作用。
(9)血红蛋白：存在于红细胞中的含Fe2+的蛋白质。其特性是在氧浓度高的地方与氧结合，在氧浓度低的地方与氧分离。
(10)动物细胞间质：主要含有胶原蛋白等成分，在进行动物细胞培养时，用胰蛋白酶处理才能获得单个细胞。
(11)分泌蛋白是指在细胞内合成后，分泌到细胞外起作用的蛋白质。例如：唾液淀粉酶，胃蛋白酶，消化酶，抗体和一部分激素。注：例如呼吸酶就不属于分泌蛋白。
(12)细胞骨架:是指真核细胞中的蛋白纤维网络结构.它在细胞内参与物质运输、能量转换、信息传递等。
(13)通道蛋白:是横跨质膜的亲水性通道，允许适当大小的离子顺浓度梯度通过，包括离子通道、孔蛋白、水孔蛋白。
蛋白质的分类,从来源上可以分为动物蛋白质、植物蛋白质从营养学上可以分为完全蛋白质、半完全蛋白质、不完全蛋白质。1.来源分类
(1)动物性蛋白质:主要包括-些动物的肉类(比如牛肉、猪肉、肉、鸡肉等)以及蛋类(鸡蛋、鸭蛋、鹌鹑蛋等)、奶产品(牛奶、羊奶等)等,含有较多的氨基酸,有丰富的营养成分,易吸收。
(2)植物性蛋白质:主要来源于豆制品(豆腐、豆豉、豆浆等)或者是谷类(大米、麦小等)等食品，含有不同含量的植物蛋白质。
2.营养学分类
(1)完全蛋白质中所含氨基酸相比较来说品种比较多,数量也充足,比如:奶制品、类、动物肝脏等食物中的蛋白质。
(2)不完全蛋白质含有氨基酸种类和数量都比较少,例如动物明胶、玉米胶蛋白。
(3)半完全蛋白质氨基酸种类也比较多,但相比较来说含不足,比如麦胶蛋白中的成份。
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