内镜检查主要用于发现胃肠粘膜的糜烂、溃疡、肿物、狭窄或血管等病变，定性诊断如是否为炎性、肿瘤或恶性病变需要借助于内镜下活检进行确诊。内镜下活检是指在胃镜或肠镜下看到粘膜异常，但是不能确定其病变性质，通过活检钳粘膜组织，送到病理科，由病理科医生在显微镜下观察细胞形态特征，来最后确定诊断。
常常有人问，有没有一种检查可以取代“痛苦的”胃镜和肠镜检查，目前尚没有。因为内镜下可以直视病变，就像那个手电筒在胃黏膜上或肠粘膜上寻觅病变，非常直观地看到或没有看到病变；最重要的是，如果怀疑有问题，可以直接钳取组织进行进一步的检查，另外还可以直接治疗，这是B超、CT等其他检查不能取代的。
内镜检查之所以越来越普及，也是因为具有其他影像学检查不可替代的优势，镜下可以直接观察到粘膜的微小病变，当然这需要医生的仔细认真和识别疾病的渊博知识经验，看到微小病变，准确抓取组织，进行病理活检定性诊断，对患者有至关重要的作用。
内镜活检在临床疾病的确诊、鉴别诊断和病变预后的评估方面有着重要的作用。
对于炎性疾病的类型或早期肿瘤的发现，可以评估炎症的程度、活动性，甚至炎症的病因。如胃幽门螺杆菌感染或十二指肠粪类圆线虫感染等。对于肿瘤性疾病可以确定肿瘤的良恶性，以及分化程度，指导手术和化疗方案的确定。
另外对于微小病变活检也许会发现极早期癌前病变，对于及时治疗防止癌症进展起到了举足轻重的作用。
为通过内镜检查达到提高胃肠疾病诊断水平，不仅要求内镜医生有熟练的插镜技巧，同时要掌握内镜活检技术、熟悉粘膜病变相关的临床知识和综合分析病变能力。内镜检查不能只是追求内镜操作时间的长短，而是要追求低漏诊率和高确诊发现率。
只有这样才能突出内镜检查早期发现病变和正确诊断病变的优势。
我之前写过一篇文章，现在刚好可以用来回答你：肠镜检查下的病理病变通常有哪些呢？以我的工作经验来说，通常有以下几类：
1、息肉及息肉病：这是比较多见的，1）增生性息肉为小而无症状的黏膜息肉，绝大多数发生于直肠和乙状结肠远端，通常认为增生性息肉既不是肿瘤也不是癌前病变，但是有细胞学和分子学研究显示，这些病变具有克隆性改变，涉及到肿瘤相关的位点和基因，发生在结肠近端的大的增生性息肉与少数显示DNA甲基化和/或DNA MSI的结直肠癌有关，增生性息肉病可能具有家族性，而且与结直肠癌相关。2）炎性息肉，可能是炎症性肠病或者黏膜脱垂等引起。3）幼年性息肉，常见于儿童，表现为直肠出血，是一种少见的病变，表现为两种类型，一种为发生于婴儿，常伴有腹泻、出血、蛋白丢失性肠病和肠套叠，于幼年时可导致死亡，这种没有家族史；其余病例发生年龄不同，典型的是发生在10-20岁患者的直肠出血，所以小孩子直肠出血，不要忘记做个肠镜。4）P-J息肉，临床上常常有胃肠道息肉病、口腔黏膜色素沉着为特征，是一种常染色体显性遗传性疾病，最好发于小肠。
2、腺瘤：年龄40岁以下少见，但随着年龄的增加，发病率逐渐升高，是一种良性的上皮性肿瘤，但具有恶变的风险，通常没有症状，常具有家族倾向。又可以分为管状腺瘤、管状-绒毛状腺瘤、绒毛状腺瘤、锯齿状腺瘤等。腺瘤又可以伴有轻度/中度/重度异性增生（也有分为低级别和高级别上皮内瘤变），总之，出现了腺瘤还不用太担心，只要切除干净，定期复查就可以避免腺癌的发生。
3、癌；结直肠癌的临床表现受到肿瘤部位的影响，直肠癌常表现为出血和里急后重，左半结肠癌可导致排便习惯改变，右半结肠癌常因为慢性失血而导致贫血。对于癌来说，也不能完全谈癌色变，为什么呢？因为涉及到癌的分期，比如原位癌，浸润到黏膜肌/黏膜下/肌层等等，预后完全不一样，甚至手术方式有时候也不一样，有些情况下可以保留肠管做ESD黏膜剥离术，这一部分相对比较复杂，留待以后说明。
4、其他肿瘤，如胃肠间质瘤/类癌/神经内分泌癌/淋巴瘤/恶性黑色素瘤等等均可发生，篇幅有限，留待以后进一步普及分析，有不懂的欢迎探讨！
所以，不管良性恶性都会拿去做病理检查的！
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